《绝密敦煌计划》的故事发生在一切皆有可能的可能小学，机关王老师将同学们带到了“敦煌”，展开了闯关骑骆驼的任务。
主人公伍珊珊和霍许凭借数学技巧闯过了第一关，却对第二关毫无头绪。这时，他们遇到了清贫的小和尚，他带来师父攒的钱，却买不起壁画用的昂贵青金石。突然，三个小丫鬟挺身而出，捐出了身上所有的财物来帮助他。连冷酷精明的商人有格木都受到了感动，大方送出了珍贵的青金石。后来越来越多的人聚集起来，给小和尚带来了大饼、面粉，各种各样的东西。尽管这些东西未必用得上，但小和尚一一接受了这些好意，佛祖说，有心就好。而伍珊珊帮他们完成了朴素的愿望，写下他们的名字，让小和尚带回去写在壁画上。心中有佛与善的人们让我感动，这是信仰的力量。
但统治着敦煌的敦煌王却不一样，他过着奢靡的生活，用重金开凿佛窟，但心中却无佛。他的子民流离失所，甚至卖子卖女来果腹。一年一度的燃灯节来临时，敦煌王在佛窟里高声喧哗，甚至要对伍珊珊霍许一行人处刑。好在塑佛艺匠老狼头化身佛祖，对敦煌王循循善诱，敦促他改邪归正。最终，他幡然醒悟，悔过自身，赈济贫民。毕竟，信仰不是用黄金堆砌的，而是用心意供奉的。
沉浸在《绝密敦煌计划》中，不知不觉，一天就过去了。当早上我翻开它，阳光像碎金一般漏进了窗户；当我如梦初醒般地合上这本书时，阳光像爬山虎，静悄悄地挪开了步子。我不禁感慨，在这个年代，善意就是流通最广泛的货币。心中有佛，便处处生莲。